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基于禁忌遗传算法的RNA二级结构预测遗传算法最小自由能 RNA二级结构预测禁忌搜索 2012/4/19

生物RNA二级结构预测是生物信息学领域的一个重要研究问题。近来，研究人员提出应用元启发式算法来预测RNA二级结构。该文提出基于禁忌遗传算法的RNA二级结构预测方法(TGARNA)，给出茎区相容性检测改进方法，保留最长茎区构造茎区相容个体，以改善种群性能；同时将禁忌搜索融入遗传操作以防止近亲繁殖，保持种群多样性。仿真实验表明TGARNA算法能够有效预测RNA二级结构。